الگوریتم رایگان ایرانی در دسترس پژوهشگران دنیا قرار گرفت/ دقت بالا در شناسایی والدین واقعی انسان و دام

محمود امیری رودبار در گفت‌وگو با خبرنگار ایانا با اشاره به طراحی الگوریتمی نوین برای آزمون انساب، اظهار داشت: این آزمون برای شناسایی دقیق پدر و مادر با استفاده از اطلاعات ژنتیکی به‌کار می‌رود.

عضو هیئت علمی مرکز تحقیقات و آموزش کشاورزی و منابع طبیعی صفی‌آباد دزفول افزود: این روش در اصلاح شجره دام‌ها، مطالعات بوم‌شناسی حیوانات وحشی و حتی پزشکی قانونی نقش مهمی ایفا می‌کند.

امیری رودبار ادامه داد: در مواردی که والدین یک گوساله یا گوسفند به اشتباه در شجره ثبت شده باشد، آزمون انساب با بهره‌گیری از داده‌های ژنومی والدین واقعی را شناسایی و والدین نادرست را حذف می‌کند که این موضوع موجب اصلاح شجره و افزایش دقت برنامه‌های اصلاحی می‌شود.

وی با اشاره به نرم‌افزار جهانی CERVUS به‌عنوان پرکاربردترین الگوریتم گذشته، خاطرنشان کرد: این نرم‌افزار با وجود بیش از شش هزار استناد علمی، محدودیت‌هایی از جمله در نظر گرفتن خطای تعیین ترکیب ژنی به‌صورت یکسان در همه جایگاه‌ها و استفاده از تنها یک توزیع معنی‌داری برای کل جمعیت داشت.

امیری رودبار با بیان این‌که الگوریتم جدید با نام Pairwise این محدودیت‌ها را رفع کرده است؛ گفت: در این روش خطای ژنتیکی برای هر جایگاه ژنومی به‌طور جداگانه محاسبه شده و آزمون تعیین والد از انتخاب والد تفکیک و برای هر تست والدی توزیع مختص همان آزمون برآورد می‌شود که این تغییرات افزایش چشمگیر دقت در شناسایی والدین را به دنبال دارد.

وی با اشاره به این‌که تصحیح شجره در اصلاح نژاد دام موجب بهبود دقت محاسبه ارزش‌های اصلاحی و در نهایت افزایش عملکرد گله‌ها خواهد شد؛ افزود: همچنین در مطالعات مربوط به حیوانات وحشی مانند یوز ایرانی، امکان برآورد دقیق‌تر هم‌خونی فراهم می‌شود.

امیری رودبار با بیان این‌که این الگوریتم در شجره‌نویسی اسب‌های بومی ایران نیز می‌تواند خطاها را با دقت بیشتری برطرف کند؛ تأکید کرد: در پزشکی قانونی هم به‌عنوان ابزاری مطمئن برای تعیین والدین واقعی قابل استفاده است.

عضو هیئت علمی مرکز تحقیقات و آموزش کشاورزی و منابع طبیعی صفی‌آباد دزفول با این توضیح که الگوریتم Pairwise به‌صورت رایگان و آنلاین در دسترس پژوهشگران قرار داشته و از طریق آدرس github.com/mahmood225/PairwisePaternity قابل دریافت است؛ یادآور شد: مقاله مرتبط با این نوآوری در یکی از معتبرترین نشریه‌های بین‌المللی به نام Ecology and Evolution پذیرفته شده و در حال چاپ است.

خبرنگار: شهرزاد مسعودی